Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pagr1bF6V0H0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms