Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
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