Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm340F6RGI3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms