Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TrdnE9Q9K5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TrdnE9Q9K5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms