Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp31E9Q6Y8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms