Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Srsf11E9Q6E5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Srsf11E9Q6E5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms