Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tarbp1E9Q368 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tarbp1E9Q368 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms