Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cep350E9Q309 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cep350E9Q309 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms