Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms