Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2C0

Cfap46, Cilia and flagella-associated protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 2,641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap46E9Q2C0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cfap46E9Q2C0 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cfap46E9Q2C0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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