Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rsph10bE9PYQ0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms