Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srp54bE9PXC0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms