Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trappc8E9PWG2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trappc8E9PWG2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms