Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3002E9PW72 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3002E9PW72 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms