Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc144bE9PVZ3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc144bE9PVZ3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms