Protein–RNA interactions for Protein: E9PVF1

Gm6904, Predicted gene 6904, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6904E9PVF1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm6904E9PVF1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms