Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifit3bE9PV48 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifit3bE9PV48 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms