Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Syde2E9PUP1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Syde2E9PUP1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms