Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cngb1E1AZ71 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cngb1E1AZ71 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms