Protein–RNA interactions for Protein: E0CYV9

1110002E22Rik, RIKEN cDNA 1110002E22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1110002E22RikE0CYV9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1110002E22RikE0CYV9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms