Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp6ap1lD3Z5W0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atp6ap1lD3Z5W0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms