Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5S8

Fam46a, Family with sequence similarity 46, member A, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46aD3Z5S8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fam46aD3Z5S8 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fam46aD3Z5S8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms