Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3U4

9630041A04Rik, RIKEN cDNA 9630041A04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9630041A04RikD3Z3U4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
9630041A04RikD3Z3U4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms