Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tpm3-rs7D3Z2H9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms