Protein–RNA interactions for Protein: D3YZZ2

Tgfbr3l, Transforming growth factor, beta receptor III-like, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfbr3lD3YZZ2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Tgfbr3lD3YZZ2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tgfbr3lD3YZZ2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tgfbr3lD3YZZ2 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Tgfbr3lD3YZZ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tgfbr3lD3YZZ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Tgfbr3lD3YZZ2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tgfbr3lD3YZZ2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms