Protein–RNA interactions for Protein: D3YZI9

Pgbd5, PiggyBac transposable element-derived protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd5D3YZI9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pgbd5D3YZI9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pgbd5D3YZI9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms