Protein–RNA interactions for Protein: D3YWC7

Fam47e, Family with sequence similarity 47, member E, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam47eD3YWC7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fam47eD3YWC7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Fam47eD3YWC7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fam47eD3YWC7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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