Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Gm17333C6EQI3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms