Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Phf11cB4XVP9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Phf11cB4XVP9 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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