Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cfap58B2RW38 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cfap58B2RW38 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms