Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rrn3B2RS91 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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