Protein–RNA interactions for Protein: B1AYB6

Mbd5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd5B1AYB6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mbd5B1AYB6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mbd5B1AYB6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms