Protein–RNA interactions for Protein: B1AX39

Zcchc7, Zinc finger CCHC domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc7B1AX39 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Zcchc7B1AX39 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms