Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap3aB1AWZ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms