Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Grik3B1AS29 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Grik3B1AS29 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms