Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
H2-M5A7VMS3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
H2-M5A7VMS3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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