Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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