Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rtf1A2AQ19 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rtf1A2AQ19 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms