Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Syndig1A2ANU3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms