Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Frmpd1A2AKB4 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Frmpd1A2AKB4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms