Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Prdm12A2AJ77 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Prdm12A2AJ77 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms