Protein–RNA interactions for Protein: A2AIR5

Grin3a, Glutamate receptor ionotropic, NMDA3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin3aA2AIR5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Grin3aA2AIR5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms