Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc163A2AGD7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc163A2AGD7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms