Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Calcoco2A2A6M5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Calcoco2A2A6M5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms