Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nlrp1bA1Z198 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nlrp1bA1Z198 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms