Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
1700028J19RikA0A0U1RP08 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms