Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
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