Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Trbv19A0A0B4J1H4 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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