Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms