Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Speer3W4VSP1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms